More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3901 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 366 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  53.19 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  53.8 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  49.85 
 
 		 365 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 333 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  38.11 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  38.11 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 345 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  33.43 
 
 		 352 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 365 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  26.51 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  26.75 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  22.53 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  25 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.06 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  23.86 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  24.84 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  25.07 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  21.32 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  24.19 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  21.32 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  23.57 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.15 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  23.25 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>