More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  100 
 
 		 348 aa  726    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 337 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.64 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  29.04 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  28.66 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  28.71 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  32.02 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  28.78 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04000  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  27.9 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  27.92 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>