More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0399 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 350 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04000  putative transcriptional regulator  92.57 
 
 		 350 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4239  AraC family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 342 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  29.09 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.57 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  31.2 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 374 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.57 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 198 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03349  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  27.7 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  26.84 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  26.71 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0428  AraC family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>