More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2005 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 375 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  50.46 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  45.18 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 347 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  37.94 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  34.13 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  28.57 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.79 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.18 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.08 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  31.83 
 
 		 381 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  26.33 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  29.9 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  29.97 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  27.97 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.9 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 360 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  27.96 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.65 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  27.39 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  25.08 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  26.11 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>