More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0506 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 
334 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
353 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
353 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
353 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
344 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
341 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 
337 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 
362 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
348 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 
333 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 
356 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
344 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
345 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
345 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 
356 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 
343 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
357 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 
364 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
341 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 
336 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 
336 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 
343 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  29.28 
 
 
333 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 
343 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  29.59 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29.28 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 
335 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 
342 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  27.22 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 
331 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
343 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.55 
 
 
337 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 
365 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  29.12 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  26.59 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.91 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
333 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
345 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
350 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 
358 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
346 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
327 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  27.33 
 
 
339 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
335 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 
364 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 
359 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
343 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
356 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
336 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 
340 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
347 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
343 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>