More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2261 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 351 aa  359  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 359 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  42.67 
 
 		 342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  48.89 
 
 		 381 aa  241  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  30.31 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  29.91 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  26.96 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  29.21 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  27.01 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  24.61 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.71 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  29.62 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  29.87 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 362 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1709  Fis family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.839551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.08 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 375 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.47 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 198 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  25.86 
 
 		 339 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.19 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.73 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>