More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2682 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 380 aa  755    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  44.28 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 351 aa  99.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  23.12 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  28.68 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 335 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 341 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  31.51 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7632  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 116 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4267  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000561  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  24.32 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 105 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  27.69 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  46.34 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 105 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 105 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05327  hypothetical protein  23.68 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0183  AraC family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3994  AraC family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>