More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4267 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4267  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1486  AraC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2047  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2042  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  30.2 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4256  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933319  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  26.28 
 
 		 387 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0713  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2633  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3972  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4085  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  0.45247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.09 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2601  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0251856 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  25.34 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0381  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  43.01 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0662  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>