More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0662 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0662  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  26.35 
 
 		 387 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  27.1 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  25.99 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4085  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  0.45247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3972  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0713  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  24.58 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0381  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  30.86 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3655  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4256  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3834  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0917  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2177  AraC family transcription regulator  25.25 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0825  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 382 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1804  AraC family transcription regulator  26.18 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2633  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>