More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000561 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000561  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  691    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105834  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05327  hypothetical protein  89.19 
 
 		 333 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3994  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0183  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0203  AraC-type transcriptional regulator  38.11 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  27.01 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  22.68 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  22.77 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  20.72 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  23.38 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  23.2 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  22.9 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  22.52 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  24.15 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  21.17 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  23.03 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  22.64 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  22.12 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  22.98 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  25.12 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 389 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  22.33 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  20.72 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  24.01 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  21.82 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  24.05 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  31.13 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  22.29 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  25.64 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.16 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>