More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4693 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  24.78 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  51.16 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  23.84 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  27.68 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04000  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  31.76 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4239  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  27.76 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001133  hypothetical protein  38.61 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  44.58 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  45.78 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2928  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>