More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2928 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2928  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  748    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0938  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.762549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 347 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  26.79 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  43.93 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  26.01 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0092  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0088  AraC family transcription regulator  38.98 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.56 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03349  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1656  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359761  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.38 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  35.79 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>