More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  80.99 
 
 		 342 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  32.96 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.16 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  31.16 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  27.99 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 396 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  38.99 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  41.12 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  29.02 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  27.74 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  45.26 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>