More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4868 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 365 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  69.61 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 376 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  62.08 
 
 		 372 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 367 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  50.96 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  54.82 
 
 		 362 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  53.57 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  54.17 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  53.45 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  53.45 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  85.45 
 
 		 120 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0545  transcriptional regulator, AraC family  80.7 
 
 		 136 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  83.5 
 
 		 105 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7632  transcriptional regulator, AraC family  82.52 
 
 		 116 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  81.55 
 
 		 105 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  74.76 
 
 		 105 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.64 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  25.47 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  26.37 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.65 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 425 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.35 
 
 		 335 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.3 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  25.31 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  22.91 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  26.84 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>