More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0112 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  332  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  98.24 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0092  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 168 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 168 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 168 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  94.71 
 
 		 168 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0088  AraC family transcription regulator  97.06 
 
 		 170 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 360 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 360 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 357 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 347 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 336 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 336 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 360 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 356 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 345 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 345 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 347 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 356 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 345 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 345 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 247 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 345 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 355 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 366 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 357 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 341 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 347 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 340 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  35.44 
 
 		 368 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 345 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 343 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 382 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 342 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0713  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  37.32 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2928  helix-turn-helix domain-containing protein  43.93 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  43.43 
 
 		 330 aa  75.1  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.23 
 
 		 321 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 339 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 387 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  40.22 
 
 		 365 aa  74.7  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 389 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 389 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  27.52 
 
 		 335 aa  74.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 359 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 337 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 337 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.85 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  35.81 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>