More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4331 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 341 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 358 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  28.61 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  28.12 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  34.68 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.12 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  42.62 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  35.67 
 
 		 366 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 400 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  24.09 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 198 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  37.13 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  32.54 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.43 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  27.04 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 344 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>