More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1252 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  72.32 
 
 		 336 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6523  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317039 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6033  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.695454 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5669  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  31.33 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  32.07 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 340 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 198 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  26.61 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.88 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.07 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  37.98 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  24.53 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  43.24 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  32.42 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  31.48 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  31.48 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>