More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001133 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001133  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1020    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  44.71 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  44.58 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  44.44 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  43.06 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 105 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  43.21 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 331 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 368 aa  67  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 339 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 336 aa  67  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 342 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 375 aa  67  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 357 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 359 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 357 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 342 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  31 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>