More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2937 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  23.51 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  24.93 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001133  hypothetical protein  28.18 
 
 		 487 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  20.64 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  27.12 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  29.79 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  36.17 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  23.91 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  25.24 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  23.39 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  45.07 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.65 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0662  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  43.24 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  22.39 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>