More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4594 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  37.71 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.26 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  24.26 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.57 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  40.97 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  25.3 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  28 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  46.53 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  33.97 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  48.1 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  48.1 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  32.47 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  45 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 425 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>