More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2159 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  26.91 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  26.61 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.25 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  23.23 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.95 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.59 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03349  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 398 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.22 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  24.19 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>