More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0940 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  701    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05327  hypothetical protein  30.87 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000561  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0183  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0203  AraC-type transcriptional regulator  34.25 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3994  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  24.68 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  22.43 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  22.19 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  27.92 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  20.64 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0662  AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  29.27 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  28.66 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  27.21 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0088  AraC family transcription regulator  25.97 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  27.67 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  26.44 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  20.66 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  22.06 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.19 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 1349 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0092  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  21.17 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  27.22 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.99 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001133  hypothetical protein  33.05 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  22 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>