273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05327 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05327  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  689    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000561  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  89.19 
 
 		 333 aa  621  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3994  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0183  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0203  AraC-type transcriptional regulator  38.72 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  23.68 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  22.94 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  20.25 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  29.24 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  22.68 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  22.07 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  22.01 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  23 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  20.86 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  21.93 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  21.41 
 
 		 343 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  23.38 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  21.34 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.95 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  22.26 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  22.25 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  20.63 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  19.73 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1903  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  21.38 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  21.36 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  21.27 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  23.1 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  21.17 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>