More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4273 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4273  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 119 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.673244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  78.95 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4307  transcriptional regulator, AraC family  56.9 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 548 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 345 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  31.25 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  34.78 
 
 		 302 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 302 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 345 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.25 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  36.17 
 
 		 332 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1532  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  29.29 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 316 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 537 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 364 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 279 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  30.3 
 
 		 279 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 329 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 324 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  36.26 
 
 		 337 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 337 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 304 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 327 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 533 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  34.94 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 343 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.7 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  29.35 
 
 		 289 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 337 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.14 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.38 
 
 		 360 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 519 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 327 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 312 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 234 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 326 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 1341 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  25.45 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  34.38 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>