More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4307 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4307  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 120 aa  237  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1904  transcriptional regulator, AraC family  62.73 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4273  transcriptional regulator, AraC family  56.9 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.673244 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 322 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.63 
 
 		 360 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 290 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  29.25 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  29.52 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.54 
 
 		 323 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 360 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  30.28 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 279 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 336 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 336 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2611  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2917  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 360 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 278 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  32.65 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 313 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 530 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 410 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 356 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3518  cyclic nucleotide-binding  36.49 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.87 
 
 		 1347 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 427 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  28.57 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 355 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.35 
 
 		 1316 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.87 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 538 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 506 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 1349 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  23.23 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 329 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 299 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>