More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7852 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  32.13 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 791 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.32 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.87 
 
 		 791 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 791 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.38 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  38.3 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.16 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 777 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.21 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  23.89 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.15 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.78 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4307  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  35.29 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  21.96 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 844 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>