More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0150 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  46.98 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4321  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.65 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.91 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.75 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.53 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.65 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  21.69 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.19 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  25 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.93 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  23.24 
 
 		 791 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 791 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  23.62 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 791 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  23.57 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  23 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.65 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>