More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4320 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4321  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 777 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.47 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.4 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.4 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.4 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  27.4 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.94 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 791 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.71 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  20.19 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 791 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.52 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.89 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  22.04 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  23.2 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.93 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3015  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.947427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  22.74 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  25 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  23.2 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.73 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.27 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 844 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>