More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3015 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3015  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.947427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1903  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  20.78 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.74 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  37.65 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 118 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1531  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00128514  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>