24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4321 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4321  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  23.36 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 339 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  19.69 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  20.41 
 
 		 791 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>