More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2883 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  35.99 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  33.58 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  39.38 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  38.24 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3977  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  44.78 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.16 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 143 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.01 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  46.85 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.44 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  41.73 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  33.14 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5466  helix-turn-helix-domain containing protein AraC type  28.89 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  41.35 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  35.46 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0064  helix-turn-helix, AraC type  32.72 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.585972  normal  0.173321 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.14 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.01 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>