More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0126 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 326 aa  650    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  38.34 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  28.72 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  27.51 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 777 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 791 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.52 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 791 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 791 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.95 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.78 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  21.97 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1834  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 844 aa  60.1  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.64 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  28.4 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  34.23 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 556 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 533 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>