More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1834 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1834  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 328 aa  642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3198  transcriptional regulator, AraC family  50.91 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3196  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1907  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  32.69 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 1341 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.38 
 
 		 791 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.06 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.69 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  27.68 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1141 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.44 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  31.37 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.65 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  31.07 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 1125 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 1121 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.12 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  36.96 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>