215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3196 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3196  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3198  transcriptional regulator, AraC family  41.39 
 
 		 353 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1834  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 328 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  30.97 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  35.09 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.75 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 777 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.13 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 382 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.37 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  26.97 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 791 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 386 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 171 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 368 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 348 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6288  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.34 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.34 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19070  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.137069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>