178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3198 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3198  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 353 aa  707    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1834  transcriptional regulator, AraC family  50.91 
 
 		 328 aa  268  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3196  transcriptional regulator, AraC family  41.7 
 
 		 276 aa  189  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  34.02 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 791 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 791 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  25.56 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.58 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  35.85 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.58 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1907  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 777 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.17 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  30.7 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.21 
 
 		 791 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  23.38 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 844 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.31 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19070  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>