55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1907 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1907  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1834  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.170119  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.08 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3198  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  25.48 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  24.31 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  26.61 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0885  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 440 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 793 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>