More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4958 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  336  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  43.61 
 
 		 309 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 354 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 305 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  46 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 326 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 326 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 326 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 319 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 319 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 338 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 316 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 328 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 339 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  41.28 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  34.31 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  39.36 
 
 		 348 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 317 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 323 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  39.39 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 348 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.27 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 332 aa  62  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.33 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 327 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.45 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3134  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  38.83 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0605  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  39.18 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>