More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0094 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  85.03 
 
 		 187 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 295 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  38.14 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 285 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 369 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 281 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0907  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09770  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 340 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 274 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 289 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  30.48 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  24.6 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 346 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  32.04 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  32.04 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  23.61 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  32.04 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  32.04 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  32.04 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 280 aa  62  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 255 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 316 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 513 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 367 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.09 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30 
 
 		 367 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30 
 
 		 367 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>