More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4632 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 380 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  73.67 
 
 		 382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  66.4 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  26.93 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 777 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  26.16 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  23.55 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 791 aa  72.8  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.58 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.43 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  25.91 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.2 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.2 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 313 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  31.52 
 
 		 1376 aa  66.2  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  24.01 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.31 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.21 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  37 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>