More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1405 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 391 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  31.89 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 279 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 791 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.62 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.33 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  28.7 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  24.91 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 791 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.28 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 171 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.57 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.87 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>