More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2758 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 318 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 279 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  27.18 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.98 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  25.08 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  36.09 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  25.46 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.29 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  20.82 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.85 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.27 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.12 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.55 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  21.86 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.57 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  29.59 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  35.42 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  23.27 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>