More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0139 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  98.74 
 
 		 332 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  52.55 
 
 		 350 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  27.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 375 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  24.57 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.02 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  28.78 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.95 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.44 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.44 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  27.44 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.44 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.25 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.72 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.45 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  28.5 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.45 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  25.91 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.33 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 777 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 791 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.21 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  28.89 
 
 		 1384 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>