More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3428 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 265 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  31.75 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  30.92 
 
 		 279 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  23.79 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  22.9 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  24.11 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  22.83 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  22.4 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 1349 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.79 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  22.1 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  22.79 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.39 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  24.77 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.3 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  21.2 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  23.86 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  21 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  23.14 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  23.65 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  22.41 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  28.99 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  23.25 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.15 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  29.41 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 410 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  22.47 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.61 
 
 		 1373 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  27.33 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3518  cyclic nucleotide-binding  36.28 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>