More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  97.27 
 
 		 293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 293 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 290 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  45.48 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  43.79 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  43.1 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.4 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 298 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  28.57 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.86 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  25.1 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  22.4 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  20.97 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  39.36 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  21.77 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.89 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  22.82 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  23.48 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1424  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  23.91 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  21.69 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.73 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.73 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  39 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  27.35 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.93 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  27.42 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  27.42 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>