More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5909 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
291 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  96.56 
 
 
291 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  74.65 
 
 
311 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  69.9 
 
 
314 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  46.41 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.8 
 
 
297 aa  92  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 
301 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.8 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  24.08 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.01 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 
341 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
266 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  38.54 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  35.96 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>