More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2917 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2917  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  70.39 
 
 		 330 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  37.91 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  37.46 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 368 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  40.07 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  34.57 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1576  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  36.91 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  36.91 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  35.37 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 369 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  32.49 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  33 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.41 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 371 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.04 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  36.1 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  36.33 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  32.7 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>