More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3436 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
279 aa  584  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 
339 aa  79  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  23.76 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
533 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  23.41 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  35.05 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 
519 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  23.1 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
198 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.71 
 
 
164 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  25.19 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0209  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.64 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.36 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.65 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.08 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  41.46 
 
 
1366 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  25.59 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  36 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  36 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  36 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  36 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0208  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  36 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  36.73 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  36 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 
760 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
1201 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.34 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
538 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.34 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  35.71 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  34.91 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  26.04 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  24.82 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  24.62 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  32.73 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  24.62 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
136 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4384  transcriptional activator RhaS  36 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.34 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  24.82 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  32.08 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  35 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
778 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  25.19 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  35.71 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
719 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  25.19 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  34.34 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.7 
 
 
530 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>