More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0803 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.56 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  42.61 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  38 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  38.18 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.21 
 
 		 1306 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  38.24 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 548 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  24.18 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  36.7 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  38.78 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  37.5 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  36.7 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  36.7 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  34.86 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  37.23 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  35.19 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>