More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2356 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  39.72 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 360 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 530 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.43 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.13 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  38.68 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03792  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  25.68 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.31 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03741  hypothetical protein  25.68 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4065  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  25.78 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  35.9 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  26.17 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  26.17 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  21.3 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  32.81 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  26.17 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  26.17 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  29.71 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.71 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.61 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.53 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.89 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4386  transcriptional activator RhaR  25.78 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.815414  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  29.71 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>