More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6978 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.38 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.04 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.04 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.04 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.1 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03792  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  24.9 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4386  transcriptional activator RhaR  23.53 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.815414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03741  hypothetical protein  24.9 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.9 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  23.53 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.1 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  35 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.71 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.93 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  23.74 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  31.93 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  23.74 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  24.12 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  24.12 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.36 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  19.39 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.94 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.9 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4065  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.92 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4263  transcriptional activator RhaR  24.06 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 506 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.37 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4292  transcriptional activator RhaR  22.9 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.75 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.45 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4378  transcriptional activator RhaR  22.9 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 1201 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  20.45 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  26.36 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4332  transcriptional activator RhaR  22.9 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0206667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  34.62 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 118 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>